Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
SRSF4Q08170 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SRSF4Q08170 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms