Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GABPB1Q06547 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPB1Q06547 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms