Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRKCDQ05655 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKCDQ05655 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms