Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POU5F1Q01860 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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