Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MDM2Q00987 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MDM2Q00987 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MDM2Q00987 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MDM2Q00987 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDM2Q00987 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDM2Q00987 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MDM2Q00987 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDM2Q00987 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDM2Q00987 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDM2Q00987 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDM2Q00987 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MDM2Q00987 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MDM2Q00987 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDM2Q00987 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDM2Q00987 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MDM2Q00987 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MDM2Q00987 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms