Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA4Q00056 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms