Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACTA1P68133 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms