Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RPS28P62857 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RPS28P62857 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RPS28P62857 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS28P62857 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS28P62857 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS28P62857 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS28P62857 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS28P62857 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS28P62857 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS28P62857 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS28P62857 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
RPS28P62857 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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