Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TMEM258P61165 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms