Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ACTBP60709 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
ACTBP60709 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ACTBP60709 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ACTBP60709 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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ACTBP60709 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ACTBP60709 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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ACTBP60709 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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ACTBP60709 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACTBP60709 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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