Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFRD-1P60508 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFRD-1P60508 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms