Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LOXL3P58215 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms