Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTCP1P56278 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms