Protein–RNA interactions for Protein: P51957

NEK4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, humanhuman

Predictions only

Length 841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4P51957 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NEK4P51957 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NEK4P51957 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEK4P51957 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NEK4P51957 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NEK4P51957 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms