Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MRE11P49959 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MRE11P49959 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MRE11P49959 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MRE11P49959 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MRE11P49959 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MRE11P49959 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MRE11P49959 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MRE11P49959 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MRE11P49959 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms