Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPAP49450 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPAP49450 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPAP49450 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CENPAP49450 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CENPAP49450 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms