Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ALDH9A1P49189 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms