Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ACADSBP45954 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms