Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPOP42166 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPOP42166 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPOP42166 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPOP42166 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPOP42166 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPOP42166 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPOP42166 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPOP42166 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPOP42166 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPOP42166 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPOP42166 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPOP42166 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPOP42166 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPOP42166 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPOP42166 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPOP42166 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPOP42166 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPOP42166 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPOP42166 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPOP42166 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMPOP42166 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMPOP42166 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMPOP42166 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TMPOP42166 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPOP42166 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms