Protein–RNA interactions for Protein: P40199

CEACAM6, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM6P40199 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CEACAM6P40199 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms