Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDRP35968 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDRP35968 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDRP35968 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDRP35968 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDRP35968 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDRP35968 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDRP35968 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDRP35968 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDRP35968 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDRP35968 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDRP35968 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDRP35968 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDRP35968 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDRP35968 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KDRP35968 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
KDRP35968 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDRP35968 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDRP35968 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDRP35968 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDRP35968 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDRP35968 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDRP35968 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDRP35968 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDRP35968 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDRP35968 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDRP35968 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDRP35968 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDRP35968 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KDRP35968 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDRP35968 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDRP35968 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KDRP35968 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDRP35968 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDRP35968 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDRP35968 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KDRP35968 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDRP35968 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDRP35968 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDRP35968 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDRP35968 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDRP35968 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDRP35968 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDRP35968 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDRP35968 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDRP35968 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDRP35968 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDRP35968 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KDRP35968 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KDRP35968 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KDRP35968 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KDRP35968 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KDRP35968 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDRP35968 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDRP35968 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDRP35968 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDRP35968 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDRP35968 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KDRP35968 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms