Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LOXP28300 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LOXP28300 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LOXP28300 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms