Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSMB5P28074 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms