Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR2AP24928 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLR2AP24928 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms