Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TAF1P21675 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1P21675 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1P21675 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1P21675 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1P21675 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1P21675 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1P21675 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1P21675 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1P21675 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1P21675 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1P21675 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1P21675 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1P21675 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1P21675 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1P21675 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1P21675 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TAF1P21675 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1P21675 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1P21675 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1P21675 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1P21675 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1P21675 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1P21675 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1P21675 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1P21675 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1P21675 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1P21675 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1P21675 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1P21675 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1P21675 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TAF1P21675 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1P21675 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1P21675 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1P21675 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1P21675 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1P21675 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1P21675 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1P21675 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1P21675 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1P21675 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1P21675 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1P21675 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1P21675 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1P21675 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1P21675 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1P21675 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TAF1P21675 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TAF1P21675 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1P21675 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1P21675 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1P21675 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1P21675 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1P21675 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1P21675 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1P21675 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1P21675 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1P21675 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1P21675 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1P21675 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1P21675 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1P21675 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TAF1P21675 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1P21675 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1P21675 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1P21675 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1P21675 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1P21675 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1P21675 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1P21675 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1P21675 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1P21675 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1P21675 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1P21675 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1P21675 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1P21675 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1P21675 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1P21675 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TAF1P21675 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms