Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CXCL3P19876 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CXCL3P19876 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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