Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRAFP15056 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRAFP15056 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRAFP15056 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRAFP15056 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRAFP15056 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRAFP15056 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRAFP15056 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BRAFP15056 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRAFP15056 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRAFP15056 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRAFP15056 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRAFP15056 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRAFP15056 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRAFP15056 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRAFP15056 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRAFP15056 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BRAFP15056 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BRAFP15056 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRAFP15056 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRAFP15056 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRAFP15056 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRAFP15056 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRAFP15056 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRAFP15056 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRAFP15056 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRAFP15056 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BRAFP15056 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BRAFP15056 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BRAFP15056 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms