Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NR2F1P10589 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NR2F1P10589 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms