Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ITGAVP06756 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ITGAVP06756 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms