Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SERPIND1P05546 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms