Protein–RNA interactions for Protein: O60542

PSPN, Persephin, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPNO60542 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSPNO60542 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSPNO60542 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSPNO60542 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms