Protein–RNA interactions for Protein: O15541

RNF113A, RING finger protein 113A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF113AO15541 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF113AO15541 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF113AO15541 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF113AO15541 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF113AO15541 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF113AO15541 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF113AO15541 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF113AO15541 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF113AO15541 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF113AO15541 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF113AO15541 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF113AO15541 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF113AO15541 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF113AO15541 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF113AO15541 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF113AO15541 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF113AO15541 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms