Protein–RNA interactions for Protein: O15228

GNPAT, Dihydroxyacetone phosphate acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPATO15228 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPATO15228 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPATO15228 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPATO15228 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPATO15228 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNPATO15228 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNPATO15228 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNPATO15228 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNPATO15228 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNPATO15228 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms