Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBDO15205 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
UBDO15205 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
UBDO15205 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
UBDO15205 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBDO15205 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBDO15205 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBDO15205 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBDO15205 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBDO15205 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBDO15205 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBDO15205 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBDO15205 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
UBDO15205 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBDO15205 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBDO15205 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBDO15205 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBDO15205 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBDO15205 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBDO15205 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UBDO15205 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBDO15205 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms