Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NEDD8-MDP1E9PL57 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms