Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DBX1A6NMT0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms