Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
IRGMA1A4Y4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms