Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Z2

LINC01558, Uncharacterized protein encoded by LINC01558, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01558Q9Y6Z2 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
LINC01558Q9Y6Z2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
LINC01558Q9Y6Z2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms