Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MED23Q9ULK4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms