Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PACSIN3Q9UKS6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms