Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPG2Q9UBF2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms