Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HMG20BQ9P0W2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMG20BQ9P0W2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms