Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NRIP3Q9NQ35 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms