Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CLSTN2Q9H4D0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CLSTN2Q9H4D0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms