Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BPESC1Q9GZL8 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms