Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KLHL4Q9C0H6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms