Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UPF3BQ9BZI7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UPF3BQ9BZI7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms