Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSBP3Q9BWW4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms