Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVN2

RUSC1, RUN and SH3 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1Q9BVN2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RUSC1Q9BVN2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUSC1Q9BVN2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUSC1Q9BVN2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUSC1Q9BVN2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUSC1Q9BVN2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUSC1Q9BVN2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RUSC1Q9BVN2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUSC1Q9BVN2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms