Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KATNB1Q9BVA0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KATNB1Q9BVA0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms